Dødstælling
Fredag den 22. december 1978 tilståede Gacy endelig for politiet, at han dræbte mindst 30 mennesker og begravede de fleste af resterne af ofrene under det gennemsøgningsrum i hans hus. I henhold til bogen Killer Clown: The John Wayne Gacy Murders Af Sullivan og Maiken sagde Gacy, at 'hans første drab fandt sted i januar 1972, og den anden i januar 1974, cirka halvandet år efter hans ægteskab.' Han indrømmede endvidere, at han ville lokke sine ofre til at blive håndjernet, og så ville han seksuelt angribe dem. For at dæmpe skrig fra sine ofre, ville han fylde en sok eller undertøj i deres mund og dræbe dem ved at trække et reb eller bord mod halsen, da han voldtog dem. Gacy indrømmede at nogle gange holdt de døde kroppe under hans seng eller på loftet i flere timer, før de til sidst begravede dem i gennemsøgningsrummet.
Den første dag, hvor politiet begyndte deres grave, fandt de to kroppe. En af ligene var John Butkovich, der blev begravet under garagen. Den anden krop var den, der blev fundet i gennemsøgningsrummet. Efterhånden som dagene gik, voksede kropstællingen højere. Nogle af ofrene blev fundet med deres undertøj, der stadig var dybt i halsen. Andre ofre blev begravet så tæt sammen, at politiet troede, at de sandsynligvis blev dræbt eller begravet på samme tid. Gacy bekræftede over for politiet, at han ved flere lejligheder havde dræbt mere end en person på en dag. Årsagen til, at han gav for dem, der blev begravet så tæt sammen, var, at han var ved at løbe tør for rummet og havde brug for at spare plads.
Den 28. december havde politiet fjernet i alt 27 organer fra Gacy's hus. Der blev også fundet et andet organ uger tidligere, men det var ikke i gennemsøgningsrummet. Det nøgne lig af Frank Wayne 'Dale' Landingin blev fundet i Des Plaines -floden. På tidspunktet for opdagelsen var politiet endnu ikke opmærksomme på Gacy's forfærdelige forbrydelser, og sagen var stadig under efterforskning. Men efterforskere fandt Landingins kørekort i Gacy's hjem og forbandt ham til den unge mands mord. Landingin var ikke den eneste af Gacys ofre, der blev fundet i floden.
Den 28. december fjernede politiet også fra Des Plaines -floden kroppen af James 'Mojo' Mazzara, der stadig fik sit undertøj fastlagt i halsen. Coroner sagde, at undertøjet fyldte offerets hals havde fået Mazzara til at kvæle.
Gacy fortalte politiet, at grunden til, at han bortskaffede ligene i floden, var fordi han løb tør for plads i sit gennemsøgningsrum, og fordi han havde oplevet rygproblemer fra at grave gravene. Mazzara var det 29. offer for Gacy's, der blev fundet, men det ville ikke være den sidste.